Ihre Wurzeln reichen zurück ins Jahr 1564, zur Gründung des Collegium Willibaldinum, des ersten Priesterseminars nördlich der Alpen. 1924 entstand daraus eine Philosophisch-Theologische Hochschule. Die zweite Wurzel ist die 1958 von den bayerischen Bischöfen gegründete Pädagogische Hochschule Eichstätt. Die beiden kirchlichen Hochschulen wurden 1972 zur Gesamthochschule Eichstätt vereinigt und 1980 in den Stand einer Universität erhoben. Seit 1989 gibt es die Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät mit Sitz in Ingolstadt. Die Hochschule wurde daher 2001 in Katholische Universität Eichstätt-Ingolstadt umbenannt.
Die KU versteht katholisch im ursprünglichen Sinn als „das Ganze betreffend“ – sie hat den ganzen Menschen, die ganze Gesellschaft im Blick. Sie vermittelt Fachwissen und soziale Kompetenz auf dem Fundament christlicher Werte. Zugleich achtet und fördert sie die Freiheit von Forschung und Lehre. Aufgrund dieser Leitidee legt die KU besonderen Wert auf interdisziplinären Austausch und internationale Vernetzung, auf Nachhaltigkeit sowie Werte- und Persönlichkeitsbildung. In vielfältigen Kooperationen schlägt die KU die Brücke zur Gesellschaft.
Die KU möchte Mitverantwortung für die Gesellschaft übernehmen und diese Haltung auch ihren Studierenden vermitteln. Diese Verantwortlichkeit zeigt sich auch beim Angebot Studium.Pro, das Studierenden offensteht, um ihr Fachstudium und ihren Bildungsweg zu bereichern. Gesellschaftliches Engagement, interdisziplinäre Auseinandersetzung mit aktuellen Fragen, projektorientiertes Lernen und die fachübergreifende Beschäftigung mit Themen werden hier gezielt gefördert und können auch als Studienleistung eingebracht werden.
Mit rund 5000 Studierenden ist die KU die kleinste Universität Bayerns. Studieren und Forschen in Eichstätt und Ingolstadt bedeutet Arbeiten in familiärer Atmosphäre: kleine Gruppen statt überfüllter Hörsäle, individuelle Beratung und persönliche Kontakte statt anonymer Massenabfertigung. Gewährleistet wird die hervorragende Betreuung von 115 Professorinnen und Professoren, 379 wissenschaftlichen Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern, fast 400 Beschäftigte in der Verwaltung und Bibliothek sowie zahlreichen Lehrbeauftragten aus der Praxis. Kurze Wege und eine hervorragende Ausstattung von Bibliothek und Rechenzentrum runden die exzellenten Studienbedingungen ab. Der Campus der KU ist – sowohl in Eichstätt als auch in Ingolstadt – nur wenige Meter von der Stadtmitte entfernt. In höchstens zehn Minuten ist zu Fuß alles erreichbar, was Studierende brauchen.